A forma de jogar Minecraft Classic é bem simples. O movimento do personagem fica nas teclas W, A, S, D, como em outros jogos de PC, e a visão é controlda pelo mouse. As teclas 1 a 9 ou a roda do mouse selecionam diferentes blocos para construção. Um clique do botão esquerdo remove blocos. Ao clicar com o botão direito, liga-se o modo de colocar blocos. Nesse modo, o botão esquerdo coloca blocos nas posições mostradas na tela.